郑州大学医科教育源于1928年的河南中山大学，1952年医学院独立建院，开启了河南医学高等教育的先河，1984年河南医学院更名为河南医科大学，基础部更名为基础医学院。2000年7月，原郑州大学、郑州工业大学、河南医科大学三校合并成立了新郑州大学，基础医学院为郑州大学的二级学院，下设10个系、1个基础医学实验中心，4个科级办公室。
学院是国务院恢复学位制后首批博士、硕士学位授权单位，拥有基础医学一级学科博士学位授权点（涵盖5个二级学科和2个自主设立二级学科博士授权点）、基础医学一级学科硕士学位授权点（涵盖6个二级学科和4个生物学二级学科硕士授权点、1个药学二级学科硕士学位授权点）。学院现有国家重点（培育）学科1个、省级特色学科1个。肿瘤防治与转化医学进入国家一流学科建设序列。学院也是河南省首家博士后流动站单位。
基础医学院现有教职工192人，其中正高39人、副高72人，具有博士学位教师145人，博士生导师32人，硕士生导师96人。中科院院士1人，长江学者3人，国家杰出优青（海外）基金获得者1人，河南省政府特殊津贴4人，河南省“百人计划”特聘专家1人，河南省黄河友谊奖获得者1人，河南省学术技术带头人6人，教育部新世纪人才计划1人，河南省特聘教授8人，河南省“中原领军人才”3人，河南省“中原英才”2人，河南省优秀专家2人，河南省教育厅学术技术带头人14人，郑州大学学科特聘教授12人，青年拔尖人才2人。
学院将继续秉持“求是担当”的大学使命，立足河南、面向全国、放眼世界，以学科建设为基、人才梯队建设为本，进一步夯实基础、砥砺奋进，推进基础医学教育的发展，努力打造世界一流学科，开创全新美好的未来！
（注：数据截止时间2024年9月）
